Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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