Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
E9PCH4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
E9PCH4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PCH4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PCH4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms