Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B4DXG7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
B4DXG7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms