Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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