Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYVE1Q9Y5Y7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms