Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIT1Q9Y2X7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIT1Q9Y2X7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms