Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms