Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TRIM35Q9UPQ4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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