Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms