Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHORDC1Q9UHD1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms