Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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