Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms