Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms