Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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