Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms