Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MKS1Q9NXB0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms