Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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