Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms