Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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