Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K7

STRADB, STE20-related kinase adapter protein beta, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBQ9C0K7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STRADBQ9C0K7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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