Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms