Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms