Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms