Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN1Q9BY11 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms