Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms