Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YIPF4Q9BSR8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms