Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms