Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms