Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms