Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms