Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms