Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms