Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms