Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms