Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms