Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms