Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms