Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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