Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms