Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms