Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms