Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CNNM3Q8NE01 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNNM3Q8NE01 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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