Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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VWA5B2Q8N398 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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VWA5B2Q8N398 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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VWA5B2Q8N398 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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VWA5B2Q8N398 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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VWA5B2Q8N398 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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