Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms