Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms