Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC174Q6PII3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC174Q6PII3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms