Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms