Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms