Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf135Q5VTT2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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