Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP9Q5VTM2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms